Estos son algunos de los apellidos muiscas que persisten en la actualidad
- Bocarejo
- Bulla
- Cabiativa
- Caipa
- Caita
- Chiguasuque
- Chingate
- Chisaba
- Chitiva
- Cucunubá
- Fiquitiva
- Jativa
- Muzuzu
- Neuta
- Nivia
- Niviayo
- Piracun
- Quinche
- Sastoque
- Siachoque
- Solaque
- Tibaquichá
- Tibaquirá
- Tenjo
- Toquica
- Tunjano
- Tunjo
- Yopasá